Elle a étudié la viole de gambe avec Ariane Maurette à Genève, puis à la Schola Cantorum de Bâle avec Jordi Savall jusqu'au diplôme de soliste qu'elle obtient en 1983.
Ses activités professionnelles se partagent entre les concerts et l'enseignement. Son attirance pour la musique de chambre lui a permis de participer à de nombreux concerts avec les meilleurs ensembles baroques européens : Les Arts Florissants, La Chapelle Royale, l'Ensemble Baroque de Limoges, L'Europe Galante, Concerto di Milano, The Monteverdi Choir.
Sylvie Moquet a également participé à de nombreux enregistrements radiophoniques (France Culture et France Musique), ainsi que discographiques : Armide de Lully avec La Chapelle Royale, Les Pièces de Clavecin en Concert de J-P Rameau, L'Incoronazione di Dario opéra de Vivaldi, les Sonates de D. Buxtehude, Les Concerts à 2 violes Esgales de M. de Sainte-Colombe avec A.M Lasla.