C'est à Strasbourg que Christophe Einhorn obtient sa licence de musicologie et sa médaille d'or de chant. Il travaille par la suite au Studio Versailles Opéra avec René Jacobs et Rachel Yakar, et fera ses débuts sur scène au Théâtre des Champs Elysées dans Giasone de Cavalli avant d'aborder de nombreux rôles, même si son répertoire de prédilection reste l'oratorio.
Il s'est produit sous la direction de Rifkin, Rilling, Corboz, Goodman, Niquet, Jacobs, Coin, Hager, Cao, Schneider, Gester ou encore Minkovski. De nombreux enregistrements, notamment de Bach ou Rameau, jusqu'à Stravinsky ou Frank Martin documentent son travail.